明清

1385年（洪武十八年），江西分为5道，赣州、南安2府均属岭北道。1477年（成化十三年），设分巡岭北道于赣州，赣州、南安2府属之。1494年（弘治七年），置南赣巡抚都察院于赣州，称虔院。1516年（正德十一年），置巡抚南赣汀韶等处地方提督军务，辖江西的南安、赣州，广东的韶州、南雄州，湖南的郴州和福建的汀州等州府。1517年（正德十二年），从上犹、南康、大余3县划出部分辖地置崇义县，属南安府，至此，南安府领4县：大余、南康、上犹、崇义。1557年（嘉靖三十六年），增设分守岭北、岭东、岭南、漳南4道，统于虔院。岭北巡、守两道治赣州，赣州、南安2府隶之。1569年（隆庆三年），从安远、信丰、龙南3县划出部分辖地置定南县，隶赣州府。1576年（万历四年），以安远县原辖寻乌等15堡另置长宁县，隶赣州府。至此，赣州府领12县，南安府领4县。

1653年（清顺治十年）至1669年（康熙八年），先后撤销南赣守抚和巡、守两道。1671年（康熙十年），置分巡赣南道，辖赣州府、南安府。1731年（雍正九年)，改分巡赣南道为分巡吉南赣道，增辖吉安府。1754年（乾隆十九年），升宁都县为宁都直隶州，辖瑞金、石城2县，为赣南分设赣州府、南安府、宁都直隶州3个政区之始。同年，改分巡吉南赣道为吉南赣宁兵备道，增辖宁都直隶州。